¿En que podemos basarnos para alegar al registro que queremos que los socios de la federación sean personas físicas?

Alejandro,
si según los estatutos los socios de la federación solo pueden ser asociaciones y según la ley la Junta directiva tienen que ser socios, no es posible nombrar personas físicas en la Junta directiva.
Las personas físicas representan personas jurídicas, y las que queréis nombrar en la federación supongo que representarán a alguna asociación. Por tanto si designáis para la Junta a la asociación está resuelto el problema. Lógicamente la asociación puede cambiar cuando quiera a la persona que la representa en la federación.
Saludos,

En efecto, como indica el anterior asesor, el registro tiene razón. Pero la forma de solucionar el problema es bien sencillo: teneis que indicar que la junta gestora está formada por:
Presidencia: persona ABC, en representación de la asociación XXX
Secretaría: persona EDF, en representación de la asociación YMZC
Y así sucesivamente
Lo que ya no se es si sirve mandar un escrito de alegaciones indicando y detallando estas representaciones o si os exigirán repetir el acta fundacional.
Ánimo y adelante!