Dividir la asociación en dos grupos

Hola, nuestra entidad se dedica a una enfermedad poco frecuente. Hemos contactado con un grupo de una enfermedad muy parecida que intenta crear una asociación específica. La intención es que se integren dentro de nuestra entidad y organizarnos en dos grupos, cada uno trabajaría en su enfermedad y compartiríamos aspectos comunes.
Las dudas que nos surgen están relacionadas con el cómo organizar este modo de funcionamiento.
¿Tienen algún ejemplo de funcionamiento similar en otras entidades? ¿Algún consejo o puntos a tener en cuenta?
Gracias.