Nos gustaría saber en qué registro debe inscribirse una asociación para la conservación del medio ambiente

Las asociaciones de ámbito nacional deben inscribirse en el Registro Nacional de Asociaciones, C/ Amador de los Ríos, 7 28010 Madrid. (Tlf. 91 537 25 07 / 02 - Fax 91 537 25 08).
Que yo sepa no existe una normativa específica que exija unos requisitos especiales a una asociación del tipo que comentas, por lo que le será aplicable la común a todo tipo de asociaciones. Para una información más detallada, te recomiendo que visites esta página del Ministerio del Interior
http://www.mir.es/pciudada/asociaci/asociaci.htm