¿Podríais orientarnos sobre cómo elaborar y ejecutar presupuestos por programas?

No existe una fórmula exacta o “mejor fórmula” para hacer un presupuesto. Depende de la organización y de su estructura y de lo que se pretenda con el presupuesto. No se exactamente a que te refieres cuando dices presupuestos por programa pero puedo explicarte lo que hacemos en la empresa en la que yo trabajo. Cada área establece un presupuesto según la actividad y previsiones que tenga, basado en el control de los costes y no en el presupuesto del año anterior porque esto tiende a inflar el presupuesto cada año. Después el área financiera lo discute con cada área (quita, pone, etc…) y lo agusta para depués unir los presupuestos individuales en un presupuesto global.
No se si esto te ayuda en algo, pero puedes darme más información o preguntarme lo que quieras para poder darte más datos y orientarte mejor.