¿Pueden exigirnos en un registro municipal que tengamos la sede en el municipio?

Por pedir, pueden pedir lo que quieran; vosotros teneis la libertad de cumplirlo si os interesa.
A ver, ya más en serio:
a) ¿Seguro que os piden que la sede CENTRAL debe estar en ese municipio pequeño? Aunque podrían hacerlo, pues el reglamento del registro de de cada municipio está determinado soberanamente por cada municipio, me parece extraño. Lo habitual es exigir que haya una sede, es decir un domicilio o dirección postal (no una oficina abierta al público), lo que parece lógico.
b) En el caso de que se confirmase la exigencia de que el domicilio social o sede central de la entidad estuviese en ese ayuntamiento, vosotros vereis si os interesa por algún motivo inscribiros en ese ayuntamiento.

Como dije al principio, cada ayuntamiento es soberano para decidir lo que sea sobre materias propias de su competencia; en todo caso, podeis solicitar copia del reglamento u ordenanza donde supuestamente viene esa exigencia.
Un saludo solidario